虱目魚名稱之由來,傳說係鄭成功在鹿耳門發現此魚,詢問屬下「這是什麼魚?」,因諧音「這是虱目魚」而得名;已故前台灣省水產試驗所所長鄧火土博士認為其眼睛上有一脂性眼瞼,故被稱為「麻虱目」或「塞目魚」 (音似虱目魚);前水產試驗所台南分所林明男博士認為中南美之拉丁語系稱虱目魚為sabador,可能由此音譯「虱目」而來,而「麻虱目」亦有可能屬台灣原住民之語音;此外,亦有人認為因虱目魚形態大小類似鯖魚,鯖魚之日文發音(まさば)類似「麻虱目」而得名。虱目魚俗名除塞目魚、麻虱目外,因台南安平地區為虱目魚產地,又常做為祈求平安之拜神牲禮,因此稱為「安平魚」;為紀念國聖爺鄭成功之功績,亦有人稱之「國聖魚」;屏東地區因其嗜食海草(藻類) 而稱「海草魚」;因其體被銀白色小圓鱗,顏色如牛乳之銀白色,英文名為milkfish (牛奶魚)。以上,由虱目魚多元名稱可知它所關連到的歷史典故、魚食文化與生物特性之豐富與傳奇,在台灣所產魚類中無魚能出其右。